Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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