Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nptx1Q62443 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nptx1Q62443 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nptx1Q62443 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms