Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
TrhQ62361 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
TrhQ62361 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
TrhQ62361 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
TrhQ62361 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
TrhQ62361 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
TrhQ62361 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
TrhQ62361 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
TrhQ62361 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
TrhQ62361 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
TrhQ62361 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
TrhQ62361 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
TrhQ62361 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
TrhQ62361 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
TrhQ62361 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
TrhQ62361 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,1 ms