Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sprr1aQ62266 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sprr1aQ62266 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sprr1aQ62266 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sprr1aQ62266 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sprr1aQ62266 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1aQ62266 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1aQ62266 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1aQ62266 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sprr1aQ62266 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sprr1aQ62266 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sprr1aQ62266 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sprr1aQ62266 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sprr1aQ62266 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 658.3 ms