Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn9aQ62205 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn9aQ62205 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scn9aQ62205 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn9aQ62205 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Scn9aQ62205 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Scn9aQ62205 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Scn9aQ62205 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms