Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3cQ62181 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3cQ62181 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema3cQ62181 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema3cQ62181 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3cQ62181 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3cQ62181 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms