Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx3xQ62167 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx3xQ62167 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx3xQ62167 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx3xQ62167 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx3xQ62167 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms