Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phox2aQ62066 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phox2aQ62066 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phox2aQ62066 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phox2aQ62066 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phox2aQ62066 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phox2aQ62066 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phox2aQ62066 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phox2aQ62066 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms