Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr3Q61851 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr3Q61851 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr3Q61851 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr3Q61851 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr3Q61851 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgfr3Q61851 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgfr3Q61851 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fgfr3Q61851 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgfr3Q61851 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgfr3Q61851 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr3Q61851 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms