Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Epha7Q61772 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Epha7Q61772 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Epha7Q61772 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Epha7Q61772 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Epha7Q61772 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Epha7Q61772 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Epha7Q61772 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epha7Q61772 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Epha7Q61772 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epha7Q61772 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms