Protein–RNA interactions for Protein: Q61418

Clcn4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn4Q61418 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn4Q61418 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn4Q61418 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn4Q61418 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcn4Q61418 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clcn4Q61418 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms