Protein–RNA interactions for Protein: Q61288

Acvrl1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvrl1Q61288 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acvrl1Q61288 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acvrl1Q61288 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acvrl1Q61288 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acvrl1Q61288 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acvrl1Q61288 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acvrl1Q61288 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acvrl1Q61288 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms