Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HarsQ61035 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HarsQ61035 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HarsQ61035 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HarsQ61035 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HarsQ61035 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HarsQ61035 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HarsQ61035 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HarsQ61035 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms