Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Caprin1Q60865 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caprin1Q60865 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caprin1Q60865 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caprin1Q60865 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Caprin1Q60865 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms