Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpbQ60649 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClpbQ60649 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpbQ60649 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClpbQ60649 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClpbQ60649 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms