Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1h4Q60641 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr1h4Q60641 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr1h4Q60641 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1h4Q60641 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1h4Q60641 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms