Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sin3aQ60520 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sin3aQ60520 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sin3aQ60520 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Sin3aQ60520 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sin3aQ60520 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sin3aQ60520 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sin3aQ60520 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sin3aQ60520 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sin3aQ60520 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sin3aQ60520 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sin3aQ60520 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sin3aQ60520 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms