Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd5Q5VCS6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd5Q5VCS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms