Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Thoc6Q5U4D9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thoc6Q5U4D9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thoc6Q5U4D9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thoc6Q5U4D9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thoc6Q5U4D9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms