Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan4Q5SZT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zkscan4Q5SZT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zkscan4Q5SZT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zkscan4Q5SZT6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zkscan4Q5SZT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zkscan4Q5SZT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zkscan4Q5SZT6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms