Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CluhQ5SW19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CluhQ5SW19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CluhQ5SW19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CluhQ5SW19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CluhQ5SW19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CluhQ5SW19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms