Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1H9

Trav7d-4, T cell receptor alpha variable 7D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav7d-4Q5R1H9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,46
Trav7d-4Q5R1H9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Trav7d-4Q5R1H9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Trav7d-4Q5R1H9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Trav7d-4Q5R1H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms