Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm6bQ5NCY0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm6bQ5NCY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm6bQ5NCY0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Kdm6bQ5NCY0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm6bQ5NCY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm6bQ5NCY0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms