Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttf2Q5NC05 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttf2Q5NC05 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttf2Q5NC05 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttf2Q5NC05 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttf2Q5NC05 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttf2Q5NC05 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms