Protein–RNA interactions for Protein: Q499F0

D5Ertd577e, D5Ertd577e protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D5Ertd577eQ499F0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D5Ertd577eQ499F0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D5Ertd577eQ499F0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D5Ertd577eQ499F0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D5Ertd577eQ499F0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D5Ertd577eQ499F0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D5Ertd577eQ499F0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
D5Ertd577eQ499F0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D5Ertd577eQ499F0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D5Ertd577eQ499F0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms