Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnah12Q3V0Q1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnah12Q3V0Q1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnah12Q3V0Q1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnah12Q3V0Q1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Dnah12Q3V0Q1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnah12Q3V0Q1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnah12Q3V0Q1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnah12Q3V0Q1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnah12Q3V0Q1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnah12Q3V0Q1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms