Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C87499Q3UX49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C87499Q3UX49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C87499Q3UX49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C87499Q3UX49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C87499Q3UX49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C87499Q3UX49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms