Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B3gnt6Q3USF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B3gnt6Q3USF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B3gnt6Q3USF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B3gnt6Q3USF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B3gnt6Q3USF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
B3gnt6Q3USF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms