Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmlQ3URD2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RprmlQ3URD2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RprmlQ3URD2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RprmlQ3URD2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RprmlQ3URD2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms