Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.31■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
D13Ertd608eQ3UPR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
D13Ertd608eQ3UPR8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms