Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmi2Q3UPE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rmi2Q3UPE3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rmi2Q3UPE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rmi2Q3UPE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 693.2 ms