Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330014E10RikQ3UL33 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E330014E10RikQ3UL33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330014E10RikQ3UL33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330014E10RikQ3UL33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330014E10RikQ3UL33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330014E10RikQ3UL33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms