Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIA2

Arhgap17, Rho GTPase-activating protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap17Q3UIA2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap17Q3UIA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap17Q3UIA2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgap17Q3UIA2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap17Q3UIA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap17Q3UIA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Arhgap17Q3UIA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap17Q3UIA2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms