Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Arfgef3Q3UGY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Arfgef3Q3UGY8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Arfgef3Q3UGY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Arfgef3Q3UGY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Arfgef3Q3UGY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,3 ms