Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm45902Q3UDN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm45902Q3UDN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm45902Q3UDN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm45902Q3UDN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms