Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21440Q3TTD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21440Q3TTD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm21440Q3TTD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21440Q3TTD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21440Q3TTD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms