Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Col24a1Q30D77 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Col24a1Q30D77 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Col24a1Q30D77 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,45■■■□□ 2,15
Col24a1Q30D77 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Col24a1Q30D77 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Col24a1Q30D77 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Col24a1Q30D77 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,6 ms