Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2N2

Spopl, Speckle-type POZ protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpoplQ2M2N2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SpoplQ2M2N2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SpoplQ2M2N2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SpoplQ2M2N2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SpoplQ2M2N2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SpoplQ2M2N2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SpoplQ2M2N2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SpoplQ2M2N2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SpoplQ2M2N2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpoplQ2M2N2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SpoplQ2M2N2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SpoplQ2M2N2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms