Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne9Q1RLL3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne9Q1RLL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne9Q1RLL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne9Q1RLL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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