Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spatc1Q148B6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Spatc1Q148B6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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Spatc1Q148B6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Spatc1Q148B6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Spatc1Q148B6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spatc1Q148B6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Spatc1Q148B6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Spatc1Q148B6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spatc1Q148B6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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