Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtel1Q0VGM9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtel1Q0VGM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtel1Q0VGM9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtel1Q0VGM9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtel1Q0VGM9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtel1Q0VGM9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtel1Q0VGM9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 975.8 ms