Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
StumQ0VBF8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
StumQ0VBF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
StumQ0VBF8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
StumQ0VBF8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
StumQ0VBF8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
StumQ0VBF8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.9 ms