Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cntnap5aQ0V8T9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cntnap5aQ0V8T9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cntnap5aQ0V8T9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cntnap5aQ0V8T9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cntnap5aQ0V8T9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cntnap5aQ0V8T9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cntnap5aQ0V8T9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cntnap5aQ0V8T9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Cntnap5aQ0V8T9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Cntnap5aQ0V8T9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms