Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plac8l1Q08EJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Plac8l1Q08EJ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms