Protein–RNA interactions for Protein: Q08351

Mpl, Thrombopoietin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MplQ08351 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MplQ08351 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MplQ08351 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MplQ08351 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MplQ08351 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MplQ08351 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MplQ08351 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MplQ08351 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MplQ08351 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MplQ08351 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MplQ08351 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MplQ08351 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MplQ08351 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MplQ08351 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MplQ08351 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MplQ08351 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MplQ08351 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MplQ08351 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MplQ08351 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MplQ08351 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MplQ08351 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MplQ08351 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MplQ08351 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MplQ08351 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MplQ08351 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MplQ08351 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MplQ08351 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MplQ08351 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MplQ08351 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MplQ08351 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MplQ08351 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MplQ08351 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MplQ08351 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MplQ08351 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MplQ08351 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MplQ08351 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MplQ08351 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MplQ08351 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MplQ08351 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MplQ08351 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MplQ08351 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MplQ08351 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MplQ08351 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MplQ08351 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MplQ08351 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MplQ08351 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MplQ08351 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MplQ08351 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MplQ08351 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MplQ08351 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MplQ08351 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MplQ08351 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MplQ08351 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MplQ08351 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MplQ08351 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MplQ08351 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MplQ08351 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MplQ08351 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MplQ08351 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MplQ08351 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MplQ08351 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MplQ08351 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MplQ08351 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MplQ08351 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MplQ08351 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MplQ08351 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MplQ08351 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MplQ08351 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MplQ08351 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MplQ08351 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MplQ08351 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MplQ08351 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MplQ08351 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MplQ08351 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MplQ08351 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MplQ08351 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MplQ08351 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MplQ08351 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MplQ08351 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MplQ08351 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MplQ08351 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MplQ08351 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MplQ08351 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MplQ08351 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MplQ08351 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MplQ08351 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MplQ08351 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MplQ08351 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MplQ08351 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MplQ08351 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MplQ08351 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MplQ08351 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MplQ08351 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms