Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnn1Q08091 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnn1Q08091 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnn1Q08091 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnn1Q08091 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms