Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r236Q05A06 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r236Q05A06 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r236Q05A06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r236Q05A06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r236Q05A06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms