Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk16Q04735 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk16Q04735 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk16Q04735 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk16Q04735 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk16Q04735 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms