Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scg2Q03517 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scg2Q03517 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Scg2Q03517 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scg2Q03517 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scg2Q03517 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scg2Q03517 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scg2Q03517 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms