Protein–RNA interactions for Protein: Q03059

Chat, Choline O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChatQ03059 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChatQ03059 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ChatQ03059 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChatQ03059 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChatQ03059 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChatQ03059 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChatQ03059 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChatQ03059 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChatQ03059 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChatQ03059 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChatQ03059 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChatQ03059 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChatQ03059 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChatQ03059 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChatQ03059 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChatQ03059 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChatQ03059 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChatQ03059 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChatQ03059 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChatQ03059 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms